На основании приказа № 3 от 28 июня 1946 года по Земландскому отделу народного образования 1 сентября 1946 г. в г. Нойкурен (Пионерский) была открыта начальная школа. Количество учеников едва превышало 100 человек. Расположена школа была в небольшом немецком доме. Организатором и первым директором школы (с 1946 по 1950 год) была Омельченко Августа Леонидовна, заведующей учебной частью — Ильященко Александра Порфирьевна.

Первый коллектив учителей насчитывал 7 человек, среди которых — Егорова А.М., Никишина Т.М., Галкова В.К., Тагунова А.М., Ефремова Е.Н. Коллектив работал в труднейших условиях. Не было приборов, наглядных пособий, занятия проходили при свете коптилки. В 1947 году Нойкуренская школа решением Приморского райисполкома преобразована в семилетнюю школу. Небольшое двухэтажное здание уже не могло вместить всех школьников, поэтому в 50-е годы к нему была сделана пристройка на 4 классные комнаты.

В 1949 году в школе образовалась ученическая комсомольская организация имени Павла Корчагина.
С 1951 года по 1958 год школой руководила Варакина Анна Лаврентьевна. В 1953 году состоялся первый выпуск школы — 11 человек. В этом же году прославили школу Егорова Анастасия Михайловна, которая стала Заслуженным учителем РСФСР и Никишина Татьяна Михайловна, которой было присвоено звание «Отличник народного образования». В 1958 году было выстроено новое здание школы на ул. Рензаева, 26 (ныне — начальная школа). Это было современное, светлое, трехэтажное здание, рассчитанное на 700 учеников. В строительстве приняли активное участие учителя и школьники. Школа имела оборудованные кабинеты физики, химии и свой спортивный зал.

С 1959 года по 1961 год директором школы был Бельский Николай Иванович. В 1959 году под его руководством был заложен школьный сад.

В 1961 году директором школы стал Боровский Степан Александрович, который руководил школой почти 26 лет. Его педагогический трудовой стаж — 53 года, из которых почти 49 лет он проработал в Пионерской средней школе. Вклад его в благоустройство и расширение школы неоценим.
В 1961 году с введением политехнического обучения были построены и оборудованы школьные мастерские.
В 1962 году количество учащихся превысило 1300 человек и возникла необходимость в увеличении числа помещений.
В 1964 году к старому зданию начальной школы был пристроен третий подъезд, одновременно начались работы по расширению помещений в новой школе. Две пристройки к основному зданию, в которых разместились кабинеты физики и химии, позволили перейти на кабинетную систему обучения. В одной из пристроек разместилась столовая.
В 1965 году в школе был открыт музей, экспонаты которого собирали сами ученики.
В 1970 году первым золотым медалистом стал Пьяных Юрий.
В 1975 году было положено начало военно-патриотическому движению «Поиск», благодаря активной работе которого были собраны сведения о боевых подвигах летчиков 1 Гвардейского минно-торпедного авиационного полка КБФ

С 1987 по 2007 год школу возглавляла её выпускница Мунтян Людмила Леонидовна.

На это время пришлись все многочисленные школьные реформы и эксперименты.

Людмила Леонидовна зарекомендовала себя как хороший организатор, творческий и инициативный руководитель. Под ее руководством школа добилась новых успехов, значительно улучшилось качество обучения, возрос творческий потенциал педагогического коллектива.

Появились два кабинета информатики, стоматологический кабинет, регулярно ремонтировалось здание школы.

В 1990 году состоялся первый выпуск физико-математического класса и класса филологического профиля.

В 1994 году произошло разделение Пионерской средней школы на две школы. Школа № 1 разместилась на территории бывшей воинской части, а школа № 2 — в здании Пионерской средней школы.

В 1996 году школа № 2 праздновала 50-летие. На 1 сентября в ней работало 107 преподавателей, обучались 1634 ученика.

В 1996 году в школе № 2 был открыт класс КРО.

В 1998 году создан Совет школы, проведена первая общешкольная конференция.

В 1999 году — состоялся первый выпуск химико-биологического класса школы № 2.

1 сентября 2001 года (55 лет школе № 2) в ней работают 64 учителя, обучаются 1047 школьников. К этому моменту состоялось 48 выпусков, выпущено 5373 ученика.

В 2003 году — первый выпуск класса социально-исторического профиля школы № 2.

В 2004 году — в школе № 2 первый выпуск профильных классов: социально-экономического, технологического, естественнонаучного, гуманитарного класса с двумя подгруппами: филологической и социально-экономической.

В этом же году школа получила статус опорной школы, как школы, успешно работающей в трех направлениях: компьютеризация учебного процесса, методическая работа, профильное обучение и предпрофильная подготовка. В региональном конкурсе программ опорных школ школа № 2 стала победителем.

В 2005 году открыты естественно-математический и спортивный классы.

В 2006 году школа отметила свое 60-летие. В 2006 — 2007 учебном году в школе работали 60 педагогов, из которых 4 заслуженных учителя, 4 — Почетных работника общего образования, 11 — Отличников народного просвещения.

За годы существования школы № 2 состоялось 55 выпусков, вручены аттестаты о среднем (полном) образовании более 5800 выпускникам, из них 47 выпускников награждены золотой медалью, 91 — серебряной.
Школа № 1 была открыта постановлением главы администрации г.Пионерского Павла Васильевича Доронина от 27 июля 1994 года № 243.
За годы работы школы ее директорами были:
1994–1995 г. — Андронов Юрий Марьянович;
1995–1999 г. — Клеванная Инна Петровна;
1999–2006 г. — Спетницкая Лариса Николаевна;
2006–2007 г. — Форманенко Тамара Ивановна.

В 2006-2007 учебном году коллектив школы составлял 23 педагога, из них 9 имели высшую категорию, 7 — первую, 4 — вторую. Среди работавших в школе учителей 7 имели государственные награды.

С 1994 по 2007 год школу закончили 11 медалистов: 6 золотых и 5 серебряных.

Школа активно участвовала в областных акциях «Дети — солдатам войны», «Тебе, любимый край»; в проектах ТАСИС «Истина и последствия», «Зебра — твои права», «За право защитить себя», «Один раз увидеть в фильме, чтобы никогда не видеть в жизни»; сотрудничала с Немецко-русским домом, польскими городами Бартошице и Моронг.